قوم وحدة التحليل الاستراتيجي بالتركيز على ثلاثة مجالات هامة على الصعيد الوطني: السياسة الخارجية، الأمن الوطني، والمفاوضات الفلسطينية - الإسرائيلية. احد الاهتمامات، هي العلاقة بين فلسطين وإسرائيل. وتتركز موضوعات البحث في هذا السياق على العلاقة الأمنية، ومستقبل العلاقات السياسية والاقتصادية، و الموانع والإعاقات المحتملة لإيجاد سلام دائم، وتطبيق معاهدات السلام، والتحديات المشتركة التي قد تواجه الشعبين. أما برنامج المفاوضات الفلسطينية - الإسرائيلية فيتضمن إعداد الأوراق البحثية، وأوراق عمل سياسية، وعقد اللقاءات المشتركة بين الأكاديميين وصناع القرار والخبراء والبرلمانيين وقادة الأحزاب السياسية بهدف دراسة الموضوعات المطروحة على أجندة مفاوضات الوضع النهائي.
فـائـمـة الـمـنـشورات:
الخروج من الوضع الراهن: التوجهات الفلسطينية
أيار (مايو) 2016
التقرير النهائي، د.خليل الشقاقي
التقرير النهائي الملخص، د.خليل الشقاقي
وقف التنسيق الأمني، هاني المصري
---- تعقيب: ناصر الدين الشاعر
حل الدولة الواحدة، سام بحور
----تعقيب: راضي الجراعي و محمد دراغمة
العودة للمفاوضات، د. علي الجرباوي
----تعقيب: د. أيمن دراغمة و د. عزمي الشعيبي
المقاطعة، رجا الخالدي
----تعقيب: د. غسان الخطيب و فجر حرب
المقاومة الشعبية، سفيان أبو زايدة
----تعقيب: جمال زقوت و قيس عبد الكريم
أوراق الخبراء:
- التداعيات الاقتصادية لحل أو انهيار السلطة، د. نصر عبد الكريم
- أثر غياب السلطة على الأمن والنظام العام، سعيد زيد
- انهيار السلطة الفلسطينية وأثره على التعليم، د. نعيم أبو الحمص
- تأثيرات حل السطة أو انهيارها على الخدمات الصحية المقدمة، د. فتحي أبو مغلي
- تأثيرات حل السلطة أو انهيارها على خدمات الاتصالات والبريد، د. مشهور أبو دقة
- تداعيات انهيار السلطة الفلسطينية على خدمات البنية التحتية، د.عبد الرحمن التميمي
- تأثيرات حل السلطة أو انهيارها على القضاء وعمل المحاكم، إبراهيم البرغوثي
- دور مؤسسات الحكم المحلي في حال انهيار أو حل السلطة الفلسطينية، د. عبد الناصر مكي
- تداعيات انهيار السلطة الفلسطينية على الجوانب السياسية والمدنية، د. سفيان أبو زايدة
- مستقبل التسوية السياسية بعد حل السلطة أو انهيارها، أحمد قريع (أبو علاء)
- الخيارات السياساتية لاستيعـاب الدولـة الفلسطينية للاجئين العائدين إليها والباقين فيها - كانون ثاني (يناير) 2005- د. حازم الشنار
- حلول مقترحة لحل قضية اللاجئين - مقر المركز 21 كانون الأول (ديسمبر) 2000
- تقييم مرحلي لخطة خارطة الطريق، 18/8/2003
- ملاحظات أولية على خطة خارطة الطريق - مدخل لفرض وصاية دولية على الفلسطنينيين أم طريق نحو دولة مستقلة ذات سيادة - كانون الثاني (يناير) 2003 - د. خليل الشقاقي وعائشة أحمد
- في سياق خارطة الطريق وفك الارتباط: اعتبارات التخطيط لتدخل دولي في الصراع الفلسطيني-الإسرائيلي بإشراف: يزيد صايغ و جاريت شوبرا التقرير على هيئة نص صوري
- بعد تطبيق خطة شارون لفك الارتباط: عناصر أزمة فلسطينية - إسرائيلية جديدة - أيار (مايو) 2005 - د.خليل الشقاقي
- مائة يوم على رئاسة محمود عباس: بأي اتجاه تسير الأمور؟ - نيسان (إبريل) 2005 - د.خليل الشقاقي
- الانتخابات الفلسطينية القادمة ومستقبل القيادة الانتقالية - - تشرين الثاني (نوفمبر) 2004 - د. خليل الشقاقي
- مجلس الأمن القومي: - مؤسسة غير فاعلة وغير دستورية ويجب حلها - حزيران (يونيو) 2004 - د. خليل الشقاقي
- الانتخابات السياسية العامة: - كاستراتيجية خروج من الأزمة - آذار (مارس) 2004 - د. خليل الشقاقي
- الانسحاب الإسرائيلي من غزة: - دوافعه والتحديات التي يشكلها للسلطة الفلسطينية - شباط (فبراير) 2004 - د. خليل الشقاقي
- ماذا نريد من اللجنة الدولية لتقصي الحقائق - مقر المركز 4 كانون الأول (ديسمبر) 2000